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经过一年多的实践和探索，在新的阶段，中国的自贸区建设将更加注重制度创新和功能创新。120平方公里的新版上海自贸区应在各区域间形成化学反应，提高整体竞争力。
上海要建设2.0版的自贸区，首先要考虑自贸区建设如何与构建开放型经济新体制更加本质结合。在这一目标之下，2.0版的上海自贸区应向制造业、服务业开放并重，出口和进口并重转变，更加注重服务业开放和贸易平衡;向引进外资和对外投资并重转变，更加注重放松资本管制，提升全球资源配置功能;向贸易、投资、金融自由化并重转变，更加注重要素、商品与服务的跨境流动;向在岸与离岸业务并重转变，更加注重离岸功能的拓展等。
上海自贸区管委会副主任简大年认为，在新的阶段，自贸区建设既要注重制度创新，又要注重功能创新，要思考如何与四个中心建设和全球科创中心建设结合起来，加速建设一批高能级、面向国际的金融、贸易、航运平台和创新平台。 金融创新和科技创新是上海自贸区的重中之重。上海自贸区一方面可以依托几个片区着力建设人民币的定价、交易、清算中心;另一方面，要探索自贸区建设和自主创新示范区的“双自”联动，并认真研究跨境交易、保税研发，知识产权、保护数字安全等问题，促进研发资源、科技人才以及与科技创新相关的资源要素在自贸区框架下率先实现。
2.0版的上海自贸区，将包括陆家嘴、世博、张江、金桥以及保税区域，这些区域各有特点优势，120平方公里的区域不应是简单的物理组合，而是有机的化学反应，通过金融、贸易、航运、科技资源的相互支撑，功能叠加，促进高端服务、先进制造、科技研发、金融贸易、航运物流等产业融合发展，提升产业链的竞争力和多功能整合的系统竞争力。
而下一步上海自贸区建设也要与长三角和长江经济带发展有机融合。
